日本列島の南に位置する南十字島。この島に活発な少年ツナシ・タクトが「青春を謳歌する」ため、本土からやって来た。

フェリーに乗り遅れて焦ったタクトは無謀にも泳いで渡ろうとしたが、あえなく漂着。海岸に倒れていたところを、スガタとその許嫁のワコに救助される。その後、2人とはすぐに友人となり、南十字学園高等部入学初日もその明るく前向きな性格から、学園の面々ともすぐに馴染み、学園生活は順調にスタートした。

しかし、この島にはある秘密があった。島の地下には「サイバディ」と呼ばれる巨大兵器が安置されており、「綺羅星十字団」を名乗る組織が封印されたサイバディの力を解き放つため、封印を守る4人の巫女を狙っていたのだ。そして、封印の巫女の1人“気多の巫女”が捕らえられてその封印が破られたことで、サイバディは時間の止まった空間（通称“ゼロ時間”）内での起動が可能となってしまう。

入学初日の夜、タクトは入ってはいけないと注意されていた廃坑跡へ好奇心から潜入を試みる。しかし、そここそがサイバディが安置されている地下遺跡への入口だった。そして偶然にも、巫女の1人であるワコを拉致した綺羅星十字団のメンバーと鉢合わせし、タクトも捕まってしまう。

綺羅星十字団の1人レイジングブルは、サイバディ・アレフィストを起動させ、ワコを使ってゼロ時間の封印を解こうとする。だが、入ってこられないはずのゼロ時間へタクトが出現し、サイバディ・タウバーンを召喚してアレフィストを破壊する。彼は、綺羅星十字団が恐れる「銀河美少年」だった。

敗北を喫した綺羅星十字団だったが、トップが不在の内情を変える好機と考え、銀河美少年を倒した者が組織のリーダーとなることを決定したため、ワコだけでなくタクトも彼らに狙われることとなった。一方タクトも、ワコがサイバディの封印を保つために島の外へ出られずにいることを知り、彼女を救うべく綺羅星十字団のサイバディを全て破壊することを決意する。こうしてタクトは、輝かしい学園生活と共に綺羅星十字団との戦いへ身を投じることとなるのだった。

　摘要

　坐落於日本南方的豐饒島嶼，南十字島。某天夜晚，一位名叫特納西·塔科特的少年來到了這座島嶼上。這個獨自從大陸游來的少年，進入島上的南十字學園高中部學習。性格開朗向上的他遇到了像揚卷·和子、新藤·棲方等充滿個性的學生並與他們深入交流。但是，這個南十字學園隱藏著巨大的秘密。沉睡於地下的，巨大的人型像「賽巴迪」。圍繞著這20多個巨像，人們都抱負著各自的秘密。自稱「綺羅星十字團」的謎之秘密結社在暗中活躍，以及巫女們的歌聲，還有塔科特自身也抱有著巨大的秘密…。

以被藍天大海包圍的南國之島為舞台，有愛情、夢想、友情的『青春的謳歌』，在此掀幕！

　Ｐｌｏｔ